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Christian Jost Maître de Conférences email: jost<at>cict.fr tél : 05 61 55 64 37, fax : 05 61 55 61 54   Recherche Enseignement Publications Amorphophallus konjac

Activités de Recherche

Mes intérêts généraux portent sur la modélisation de phénomènes biologiques et sur l'identification des mécanismes sous-jacents à un patron global observé. Durant ma thèse de doctorat le patron était les dynamiques temporelles de systèmes proie-prédateur et je cherchais à identifier la fonction décrivant la consommation (réponse fonctionnelle). Depuis mon recrutement dans le CRCA (équipe Dynactom) je m'intéresse aux phénomènes auto-organisés chez les insectes sociaux. Ces animaux permettent d'observer et de quantifier directement le comportement local. Avec les outils de la modélisation mathématique et informatique on peut ensuite faire le lien avec le patron global observé, c'est-à-dire on peut valider si les mécanismes observés sont vraiment responsables du patron global. Cette mise en relation pose de nombreux problèmes d'ordre statistique et de système dynamique. Ce couplage des outils statistiques et dynamiques représente un défi actuel dans la modélisation en biologie, et les processus d'auto-organisation des insectes sociaux représentent un modèle biologique idéal pour contrôler toutes les différentes étapes.

Concrètement, je travaille sur deux projets (dans le cadre de l'axe 5 de Dynactom) :

• Construction de structures épigées par les insectes sociaux : étude expérimentale, caractérisation et modélisation.
• Cimetière de fourmis : étude expérimentale des effets de courants convectifs sur les cimetières de fourmis (agrégation de cadavres par les autres fourmis), modélisation.

Enseignement

J'interviens dans les enseignements de Licence, Master 1 et Master 2 dans le contexte de la modélisation en général et du comportement animal en particulier. Ci-dessous du matériel à télécharger pour quelques'un de mes cours/TD/TP.

Heures de présence : mon bureau se situe dans le Bât 4R3-b3, 3ème étage, porte 301. Envoyez-moi un email si vous avez des questions par rapport à mes cours, on pourra ensuite prendre rendez-vous.

• Des polycopiés d'un intérêt plus large

• L2

  • 3L3UE4M et 3L3BP04M 'Méthodologie expérimentale en SDV' (Resp. A. Sévérac-Cauquil, J.-M. Devaud)

• L3

  • 3L5BC7M 'Ethologie' (Resp R. Bon)

  • 3L6AB4M 'Ecologie comportementale' (Resp. C. Jost/R. Bon), fichier pour TP2 et accès moodle; TP3: ExDonneesGuppy-011.xls et DonneesTP3-011.xls

• M1

  • 3M7BS20M : Cognition Animale - pour information, voici mon sujet de l'examen 2004/5 ou de 2006/7 ou de 2007/8

  • 3M7BS15M 'Analyse statistique et modélisation en neurosciences et éthologie' (Resp. C. Jost)

  • 3M8ELGM 'Comportement: Socialisation et Vie en Société' (Resp. R. Bon/C. Jost)

• M2

  • M2R NCC : Neurosciences, Comportement, Cogntion

  • M2R BEE : les systèmes dynamiques en écologie - explorations avec R

  • M2P BioInfo : systèmes dynamiques et leur analyse

Remarque: tous le matériel pédagogique sur cette page a été développé dans le cadre de mon travail de Maître de conférences (rémunéré par l'état français), je le mets donc a disposition de toute la communauté francophone sous les conditions de la Licence de la documentation libre de GNU (mais en excluant une utilisation commerciale de ce matériel!).

Publications

En comportement animale (activité actuelle)

• Haifig I, Jost C, Janei V, Costa-Leonardo AM. The size of excavators within a polymorphic termite species governs tunnel topology. Animal Behaviour 2011, 82 1409-1414 (doi: 10.1016/j.anbehav.2011.09.025)
• Perna A, Kuntz P, Theraulaz G, Jost C. From local growth to global optimization in insect built networks. In Biologically inspired networking and sensing: algorithms and architectures, Lio P and Verma D (eds), IGI Global 2011 (doi : 10.4018/978-1-61350-092-7)
• Gautrais J, Jost C, Soria M, Campo A, Motsch S, Fournier R, Blanco S, Theraulaz G. Analysing fish movement as a persistent turning walker. J Math Biol 58, 429-445, 2009 (doi: 10.1007/s00285-008-0198-7, ).
• Garnier S, Gautrais J, Asadpour M, Jost C, Theraulaz G. Self-organized aggregation triggers collective decision making in a group of cockroach-like robots. Adaptive Behaviour 2009, 17, 109-133 (doi: 10.1177/1059712309103430, ).
• Perna A, Valverde S, Gautrais J, Jost C, Solé R, Kuntz P, Theraulaz G. Topological efficiency in three-dimensional gallery networks of termite nests. Physica A 387, 6235-6244, 2008 (doi:10.1016/j.physa.2008.07.019, )
• Perna A, Jost C, Valverde S, Gautrais J, Theraulaz G, Kuntz P. The topological fortress of termites. BIOWIRE Lecture Notes in Computer Science (Springer) 5151, 165-173, 2008 (eds Liò, Crowcroft, Verma, ).
• Perna E, Jost C, Couturier E, Valverde S, Douady S, Theraulaz G. The structure of gallery networks in the nests of termite Cubitermes spp. revealed by X-ray tomography. Naturwissenschaften 95, 877-884, 2008 (doi:10.1007/s00114-008-0388-6, )
• Casellas E, Gautrais J, Fournier R, Blanco S, Combe M, Fourcassié F, Theraulaz G, Jost C. From individual to collective displacements in heterogenous environments, Journal of theoretical Biology, 250, 424-434, 2007. (doi:10.1016/j.jtbi.2007.10.011, )
• Garnier S, Jost C, Gautrais J, Asadpour M, Caprari G, Jeanson R., Grimal A, Theraulaz G. The Embodiment of Cockroach Aggregation Behavior in a Group of Micro-Robots. Artificial Life, 14, 387-408, 2008. (doi: 10.1162/artl.2008.14.4.14400, ).
• Gautrais J., Jost C., Theraulaz G. Key behavioural factors in a self-organised fish school model. Annales zoologici Fennici, online available.

• Jost C., Verret J., Casellas E., Gautrais J., Challet M., Lluc J., Blanco S., Clifton MJ., Theraulaz G. The interplay between a self-organized process and an environmental template: corpse clustering under the influence of air currents in ants. Journal of the Royal Society Interface, 4, 107-116, 2007, .

• Challet M., Fourcassié V., Blanco S., Fournier R., Theraulaz G., Jost C. A new test of random walks in heterogeneous environments. Naturwissenschaften 92: 367-370 (2005). (, download Erratum Fig 1)
  Code to simulate Random walks and to illustrate the property used in this paper (use R to run the simulations)
• Challet, M., Jost C., Grimal A., Lluc J., Theraulaz G. How temperature influences displacemnts and corpse aggregation behaviors in the ant Messor sancta. Insectes sociaux, 52, 305-315, 2005 ,
• Garnier S, Jost C, Jeanson R, Gautrais J, Asadpour M, Caprari G, Theraulaz G. Aggregation Behaviour as a Source of Collective Decision in a Group of Cockroach-Like-Robots. Lecture Notes in Computer Science, 3630, 196-178, 2005, .
• Jeanson, R. , Rivault, C., Deneubourg, J.L., Blanco, S., Fournier, R., Jost, C. & Theraulaz, G. Self-organised aggregation in cockroaches, Animal Behaviour 69, 169-180, 2005 (doi: 10.1016/j.anbehav.2004.02.009, )
• Gautrais, J., Jost, C., Jeanson, R., Theraulaz, G. How individual interactions control aggregation patterns in gregarious arthropods. Interaction Studies 5, 245-269, 2004. (doi: 10.1007/s00285-008-0198-7, )

En écologie (thèse et post-doc)

• Jost, C., Devulder, G., Vucetich, J.A., Peterson, R.O., Arditi, R. The wolves of Isle Royale display scale-invariant satiation and ratio-dependent predation on moose. Journal of Animal Ecology 74, 809-816, 2005. (paper, , copyright notice)
• Arditi R, Callois J-M, Tyutyunov Y, Jost C. Does mutual interference always stabilize predator–prey
  dynamics? A comparison of models. C. R. Biologies 327: 1037–1057, 2004,
  
• Jost, C., Lawrence, C., Campolongo, F., van de Bund, W., Hill, S., DeAngelis, D. L. The effects of mixotrophy on the stability and dynamics of a simple planktonic food web model. Theoretical Population Biology 66, 37-51, 2004, .
• Y. Tyutyunov, I. Senina, R. Arditi & C. Jost. 2002. Extinction risk assessment of harvested pike-perch population in the Azov Sea. Ecological Modelling 149: 297-311, .
• C. Jost & R. Arditi. 2001. From pattern to process: identifying predator-prey interactions. Population Ecology 43: 229-243, .
• C. Jost & S. Ellner. 2000. Testing for predator dependence in predator-prey dynamics: a nonparametric approach. Proc. Roy. Soc. Lond. B 267: 1611-1620. (, get the dataset, get the Electronic Appendix)
• C. Jost & R. Arditi. 2000. Identifying predator-prey processes from time series data. Theoretical Population Biology 57: 325-337, .
• C. Jost. 2000. Predator-prey theory: hidden twins in ecology and microbiology. Oikos 90: 202-208, .
• S. Ponsard, R. Arditi, C. Jost. 2000. Assessing top-down and bottom-up control in a litter-based soil macroinvertebrate food chain. Oikos 89: 524-540, .
• C. Jost, O. Arino & R. Arditi. 1999. Behavior of the (0,0) equilibrium in a ratio-dependent predator-prey model. Bulletin of Mathematical Biology 61: 19-32. (, download Erratum)
• M. M. Dacorogna, U. A. Müller, C. Jost, O. V. Pictet, R. B. Olsen & J. R. Ward. 1995. Heterogeneous real-time trading strategies in the foreign exchange market. The European Journal of Finance 1: 383-403.

Ma thèse de doctorat (si quelqu'un veut la télécharger)

• C. Jost.1998. Comparing predator-prey models qualitatively and quantitatively with ecological time-series data. PhD-Thesis, Institut national agronomique Paris-Grignon.(Pdf-Version )

Et, last not least, mon Amorphophallus konjac s'est encore décidé à fleurir (et il pue èpouvantablement ;-)

La fleur de 2002: assez atypiquement elle a poussé en automne avant que la feuille ait flétrit.		La fleur de 2004: elle a poussé au printemps avant de faire sa feuille	La fleur d'avril 2005 : plus belle que jamais, avec un parfum extraordinaire.		Et depuis, elle attire chaque année les collègues du labo (Julie Carcaud)